因阴道闭锁或阴道中隔等先天因素引起性交障碍或困难，从而影响精子进入女性生殖道。

　　因霉菌、滴虫、淋球菌、支原体、衣原体等感染造成阴道炎症改变了阴道生化环境，降低精子活力和生存能力，从而影响受孕。

　　宫颈管先天性异常、闭锁或狭窄、息肉、糜烂、肿瘤、粘连等均可影响精子通过；宫颈粘液中存在抗精子抗体，不利于精子穿透宫颈管或完全使精子失去活动能力。

　　先天性无子宫、幼稚型子宫及无宫腔实性子宫等发育不良或畸形都会影响女性生育能力。子宫肌瘤、子宫内膜异位症、子宫内膜炎症、宫腔粘连都是造成不孕的原因。

　　输卵管过长或狭窄，输卵管炎症引起管腔闭塞、积水或粘连，均会妨碍精子、卵子或受精卵的运行。输卵管疾病可占女性不孕的25%，是不孕的重要原因。

　　卵巢发育不全、黄体功能不全、卵巢早衰、多囊性卵巢综合征、卵巢肿瘤等影响卵泡发育或卵子排出的因素都会造成不孕。

　　下丘脑-垂体-卵巢轴三者之间的调节不完善，表现为无排卵月经，闭经或黄体功能失调，这些都是不孕症的可能原因。

　　甲状腺机能亢进或低下，肾上腺皮质功能亢进或低下也能影响卵巢功能并阻碍排卵。

　　严重的先天性生殖系统发育不全，这类患者常伴有原发性闭经。性染色体异常，例如特纳氏综合征，真假两性畸形等，染色体异常易造成的习惯性流产等。

　　营养障碍，代谢性疾病，慢性消耗性疾病，单纯性肥胖等。服用生棉籽油，有毒化学试剂，放射线照射，微波等物理因素。

　　植物性神经系统功能失调，精神病，环境性闭经，神经性厌食，假孕等。

　　免疫性不孕，血型不合（如Rh血型或ABO溶血造成的习惯性流产或死胎）等。